Page 74 - ICGES Libro de Resúmenes MAC

Afiches Enfermedades Emergentes y Zoonóticas de Panamá

A­01 CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DEL VIRUS
ZIKA EN SUJETOS INFECTADOS EN PANAMÁ
DURANTE LOS AÑOS 2015 A 2018

D Araúz, C González, J Castillo, L Abrego, M Chen, L Sáenz, Y Díaz, B
Moreno, S López­Vergès, JM Pascale, A Martínez.
A­01
Instituto Conmemorativo Gorgas de Estudios de la Salud (ICGES), Ciudad de
Panamá, Panamá.

Panamá es un país de tránsito por excelencia, con un flujo constante de
personas que utilizan el país como escala o para realizar turismo. Además,
nuestra proximidad geográfica a los países vecinos y la región fronteriza
relativamente porosa facilita la introducción de nuevos virus emergentes. El
aumento de patógenos emergentes destaca la importancia de disponer de
métodos precisos y novedosos para su caracterización e identificación. La
vigilancia genómica de cepas circulantes de Zika permite una gestión eficiente
de los recursos hacia una disminución de los medios de propagación,
proporcionará además información clave sobre el origen del virus, permitirá la
caracterización de las cepas involucradas en el brote y evaluar eventos de
introducción o reintroducción del virus. Para este análisis, utilizamos muestras
de la vigilancia epidemiológica recibidas en el ICGES desde diciembre de 2015
a diciembre de 2018 de diferentes regiones de Panamá, ponderando áreas con
menos incidencia para evitar el sesgo causado por una mayor representación de
casos en el área de Guna Yala, donde comenzó el brote de Zika. Las muestras
de PCR positivas para el virus Zika se aislaron utilizando células Vero y se
realizó la extracción de ARN por métodos comerciales. Cinco fragmentos que
cubren 11500 pb del genoma de ZIKV se amplificaron. La secuenciación se
realizó de dos formas: utilizando MinION de Oxford Nanopore Technologies
(ONT) y el sistema MiSeq illumina. Un total de 10 GB de pares de secuencias de
bases fueron usados para construir el consenso y para el análisis de las
variantes. Las lecturas obtenidas se alinearon en base a una secuencia de
referencia (KU926309) con el paquete bwa­mem. Actualmente tenemos 4
secuencias de genoma completo, el análisis tuvo 100 por ciento de cobertura de
todos los fragmentos y de todos los genes. Por ahora el linaje predominante es
el asiático. La vigilancia continua de infecciones por el virus Zika es importante
debido a la posibilidad de transmisión en bancos de sangre o por las
afectaciones en neonatos. Con genomas completos, realizaremos estudios
filogenéticos y futuros estudios filogeográficos para ver si hay una selección
positiva en el tiempo de una secuencia específica.

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