Page 167 - Resúmen - XXV Congreso Latinoamericano de Parasitología - FLAP

S15-03

Biología del genoma de Trypanosoma cruzi

1
Luisa Berná , Matias Rodriguez , María Laura Chiribao , Adriana Parodi-
1,3
2
1
1,3
1,2
1,2
2
Talice ,Sebastián Pita , Gastón Rijo , Fernando Alvarez-Valin , Carlos Robello
2
1 Institut Pasteur de Montevideo. Facultad de Ciencias, UDELAR, Uruguay. Facultad de Medicina,
3
UDELAR, Uruguay.

La secuenciación del genoma de Trypanosoma cruzi, publicada por primera vez en 2005, fue realizada por
medio de mapeo físico y utilización del método de Sanger. La complejidad intrínseca de su genoma
(abundancia de secuencias repetitivas y genes organizados en tándem), sumado a las limitaciones
técnicas de los métodos de entonces, ha dificultado la posibilidad de obtener un ensamblaje y anotación
del genoma de alta calidad. Las lecturas largas generadas por las tecnologías de secuenciación de tercera
generación (Pabcio y Nanopore) son particularmente adecuadas para abordar los desafíos asociados con
el genoma de T. cruzi, ya que permiten la determinación directa de la secuencia completa de grandes
grupos de secuencias repetitivas sin colapsarlas. Esto, a su vez, no solo permite una estimación precisa
de los números de copias de genes, sino que también evita la fragmentación del ensamblaje. Aquí
presentamos el análisis de secuencias del genoma de dos clones de T. cruzi: el híbrido TCC y el no híbrido
Dm28c, determinado por PacBio. Encontramos que el genoma de T. cruzi está compuesto por un
compartimento central o core, y un compartimento disruptivo, este último localizado en regiones de ruptura
de sintenias con otros tripanosomátidos, estando compuesto casi exclusivamente por genes de
transialidasa, mucinas y MASP. Se identificaron nuevas secuencias repetitivas en tándem y dispersas,
incluidas algunas ubicadas dentro de secuencias codificantes. Además, en muchos casos pudimos
ensamblar los cromosomas homólogos por separado, lo que nos permitió recuperar haplotipos como
contigs separados en lugar de una secuencia de mosaico única, e identificar regiones de recombinación.
Finalmente, la anotación manual de familias multigénicas de proteínas de superficie permitió una mejor
visión general de estos complejos grupos de genes. En su conjunto podemos concluir que esta plasticidad
genómica constituye una estrategia clave de supervivencia durante el complejo ciclo de vida de este
parásito.

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